Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms