Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms