Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms