Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L4A6NCW7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms