Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
C9orf170A2RU37 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms