Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPDC1A2A3K4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms