Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ALG13-214ENST00000482742 620 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL445187.1-201ENST00000502685 260 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 NMNAT1P4-201ENST00000505598 840 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 NR1I3-233ENST00000515452 1093 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 NPIPP1-203ENST00000547107 1071 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL133304.1-201ENST00000548199 549 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CHCHD3P2-201ENST00000550751 639 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC023794.4-201ENST00000551732 754 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC009090.1-201ENST00000562409 358 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 SPINT1-AS1-204ENST00000568419 629 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RN7SL376P-201ENST00000578594 264 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC018521.6-201ENST00000584276 335 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 LINC00906-202ENST00000587998 648 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC060766.6-201ENST00000589099 394 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC010320.1-201ENST00000599775 578 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AP004247.4-201ENST00000608484 942 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL157392.3-206ENST00000614899 822 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.123-201ENST00000616695 286 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC013489.3-201ENST00000623274 517 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 OR5E1P-201ENST00000305754 927 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 OR10D3-201ENST00000318666 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 TCTE3-201ENST00000366774 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 SP140-202ENST00000373645 814 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CBWD5-205ENST00000377395 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 IGLC6-201ENST00000410078 317 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 OR10U1P-201ENST00000414690 905 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC073367.1-201ENST00000421480 697 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AF127577.3-201ENST00000430391 781 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AP006193.1-201ENST00000440724 485 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 RPL34P29-201ENST00000491411 325 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 LINC01411-204ENST00000510234 938 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 DCSTAMP-203ENST00000517991 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AP000757.2-201ENST00000531850 557 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC005154.1-225ENST00000581665 564 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC011472.3-201ENST00000586051 906 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC090699.1-201ENST00000586264 321 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC003002.3-201ENST00000597410 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC010719.1-201ENST00000602992 747 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CSTL1-205ENST00000619238 477 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 FGL1-203ENST00000398054 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 OR7E11P-202ENST00000642027 1491 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CRYZ-201ENST00000340866 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 CFAP61-210ENST00000451767 1946 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDK4Q16654 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms