RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412425.1

RAB6C-AS1-201, RAB6C antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB6C-AS1, Length 2,454 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NISCHQ9Y2I1 1504 aa13.57□□□□□ -0.24
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ABCC9O60706 1549 aa12.65□□□□□ -0.38
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa12.44□□□□□ -0.42
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ERICH6Q7L0X2 663 aa12.27□□□□□ -0.45
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HRCP23327 699 aa12.2□□□□□ -0.46
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 APLP2Q06481 763 aa12.2□□□□□ -0.46
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.15□□□□□ -0.46
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BCL11AQ9H165 835 aa12.06□□□□□ -0.48
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa11.99□□□□□ -0.49
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NACADO15069 1562 aa11.83□□□□□ -0.52
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.6□□□□□ -0.55
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MYO15BQ96JP2 1530 aa11.59□□□□□ -0.55
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa11.57□□□□□ -0.56
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa11.52□□□□□ -0.56
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.48□□□□□ -0.57
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.45□□□□□ -0.58
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.43□□□□□ -0.58
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ANP32EQ9BTT0 268 aa11.43□□□□□ -0.58
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.4□□□□□ -0.58
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PCGF6Q9BYE7 350 aa11.36□□□□□ -0.59
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NEUROD1Q13562 356 aa11.34□□□□□ -0.59
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa11.28□□□□□ -0.6
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.26□□□□□ -0.61
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa11.26□□□□□ -0.61
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CUX2O14529 1486 aa11.19□□□□□ -0.62
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SCRIBQ14160 1630 aa11.18□□□□□ -0.62
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PLEKHG5O94827 1062 aa11.16□□□□□ -0.62
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PODXL2Q9NZ53 605 aa11.06□□□□□ -0.64
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ERCC6Q03468 1493 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PKNOX2Q96KN3 472 aa10.98□□□□□ -0.65
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NCAPD3P42695 1498 aa10.89□□□□□ -0.67
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ERICH6BQ5W0A0 696 aa10.88□□□□□ -0.67
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.85□□□□□ -0.67
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MYT1LQ9UL68 1186 aa10.82□□□□□ -0.68
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HMGXB3Q12766 1538 aa10.81□□□□□ -0.68
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CCDC136Q96JN2 1154 aa10.8□□□□□ -0.68
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TRIM41Q8WV44 630 aa10.78□□□□□ -0.68
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SMARCA2P51531 1590 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa10.77□□□□□ -0.69
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.76□□□□□ -0.69
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NEFLP07196 543 aa10.75□□□□□ -0.69
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NESP48681 1621 aa10.74□□□□□ -0.69
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.73□□□□□ -0.69
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ARXQ96QS3 562 aa10.68□□□□□ -0.7
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SMARCA4P51532 1647 aa10.67□□□□□ -0.7
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.66□□□□□ -0.7
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PDE4CQ08493 712 aa10.64□□□□□ -0.71
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KLHL34Q8N239 644 aa10.64□□□□□ -0.71
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.64□□□□□ -0.71
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DEKP35659 375 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PEG3Q9GZU2 1588 aa10.63□□□□□ -0.71
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 WDR62O43379 1518 aa10.59□□□□□ -0.71
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FGD1P98174 961 aa10.55□□□□□ -0.72
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa10.53□□□□□ -0.72
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 OSCARQ8IYS5 282 aa10.51□□□□□ -0.73
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.51□□□□□ -0.73
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MSH5O43196 834 aa10.48□□□□□ -0.73
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZMYND15Q9H091 742 aa10.48□□□□□ -0.73
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.46□□□□□ -0.73
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa10.45□□□□□ -0.74
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa10.45□□□□□ -0.74
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.45□□□□□ -0.74
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 AAMPQ13685 434 aa10.44□□□□□ -0.74
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.44□□□□□ -0.74
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