Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 RASSF2-202ENST00000379400 5427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 ERN1-201ENST00000433197 7876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AC097717.1-225ENST00000600829 709 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 PEG10-208ENST00000615790 6394 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 DNAJC18-201ENST00000302060 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 C1orf158-203ENST00000614859 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 TTC21A-205ENST00000440121 3941 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 ZNF322-208ENST00000622479 4882 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 FAM83F-201ENST00000333407 15561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 NLRP3-204ENST00000366497 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 PCAT18-201ENST00000579458 2598 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 LINC02159-202ENST00000518580 2323 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 PDE4DIP-241ENST00000616206 874 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 TMPRSS11D-201ENST00000283916 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 PINK1-AS-201ENST00000451424 4443 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 SP140-203ENST00000392045 3246 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 FMNL3-201ENST00000335154 12634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 GABRB3-225ENST00000638099 2752 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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