Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms