Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms