Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms