Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms