Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD1AQ9Y241 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms