Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms