Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSR3Q9UNL2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms