Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms