Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJC5

SH3BGRL2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2Q9UJC5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BGRL2Q9UJC5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BGRL2Q9UJC5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms