Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH10Q9P2E7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms