Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
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