Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms