Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms