Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAK1IP1Q9NWT1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PAK1IP1Q9NWT1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAK1IP1Q9NWT1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAK1IP1Q9NWT1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAK1IP1Q9NWT1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PAK1IP1Q9NWT1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAK1IP1Q9NWT1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms