Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC1Q9NTX5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC1Q9NTX5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC1Q9NTX5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC1Q9NTX5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC1Q9NTX5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC1Q9NTX5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC1Q9NTX5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC1Q9NTX5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC1Q9NTX5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC1Q9NTX5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC1Q9NTX5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC1Q9NTX5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC1Q9NTX5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHDC1Q9NTX5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms