Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms