Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOMER3Q9NSC5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOMER3Q9NSC5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOMER3Q9NSC5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOMER3Q9NSC5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOMER3Q9NSC5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOMER3Q9NSC5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOMER3Q9NSC5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOMER3Q9NSC5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOMER3Q9NSC5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOMER3Q9NSC5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms