Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX2Q9NRD8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX2Q9NRD8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX2Q9NRD8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX2Q9NRD8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX2Q9NRD8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX2Q9NRD8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX2Q9NRD8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX2Q9NRD8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX2Q9NRD8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX2Q9NRD8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX2Q9NRD8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
DUOX2Q9NRD8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
DUOX2Q9NRD8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DUOX2Q9NRD8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DUOX2Q9NRD8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms