Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RFPL1S-202ENST00000461286 5903 ntTSL 411.41□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CACNB1-207ENST00000577582 563 ntTSL 411.39□□□□□ -0.592e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SEC31B-201ENST00000370345 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.592e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPP1R32-202ENST00000366212 488 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.592e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BBS9-201ENST00000242067 4027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MTERF4-218ENST00000488567 3854 ntTSL 211.32□□□□□ -0.62e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ITIH5-202ENST00000397146 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.62e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DDX19B-201ENST00000288071 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TRPS1-210ENST00000519815 584 ntTSL 311.22□□□□□ -0.614e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-203ENST00000542343 1011 ntTSL 211.19□□□□□ -0.622e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SEC31B-202ENST00000462434 4849 ntTSL 511.19□□□□□ -0.622e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC35B1-210ENST00000508520 845 ntTSL 511.18□□□□□ -0.622e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TRPS1-204ENST00000422939 581 ntTSL 211.15□□□□□ -0.624e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SNX6-208ENST00000556712 851 ntTSL 511.13□□□□□ -0.632e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN5A-217ENST00000593106 849 ntTSL 511.1□□□□□ -0.632e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TTYH2-208ENST00000534346 546 ntTSL 411.04□□□□□ -0.642e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 POR-204ENST00000414186 548 ntTSL 411.04□□□□□ -0.642e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AL512590.2-201ENST00000531758 1341 ntBASIC11.04□□□□□ -0.642e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-236ENST00000590040 855 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.642e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LIN54-205ENST00000505905 810 ntTSL 210.99□□□□□ -0.652e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GRAMD4-206ENST00000456069 669 ntTSL 310.94□□□□□ -0.662e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LEF1-219ENST00000512407 564 ntTSL 310.93□□□□□ -0.662e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 UTP4-207ENST00000566227 747 ntTSL 310.92□□□□□ -0.662e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CORO6-207ENST00000492276 868 ntTSL 310.91□□□□□ -0.662e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SEC31B-208ENST00000484848 3298 ntTSL 510.9□□□□□ -0.662e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LEF1-209ENST00000505297 873 ntTSL 310.85□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PIK3R3-206ENST00000488808 3117 ntTSL 210.78□□□□□ -0.682e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 UTP4-202ENST00000352319 1841 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC27-205ENST00000492985 485 ntTSL 210.59□□□□□ -0.716e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SEC31B-207ENST00000482456 3916 ntTSL 510.59□□□□□ -0.712e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FAM118B-202ENST00000525338 784 ntTSL 310.47□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BBS9-204ENST00000396127 3914 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.742e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SERINC3-204ENST00000468234 393 ntTSL 210.41□□□□□ -0.742e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPM1K-203ENST00000506423 1091 ntTSL 1 (best)10.38□□□□□ -0.754e-26■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CHID1-213ENST00000528521 323 ntTSL 510.37□□□□□ -0.756e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AC104041.1-201ENST00000560054 569 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.752e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TOR1AIP1-206ENST00000527391 593 ntTSL 510.33□□□□□ -0.762e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BBS9-202ENST00000350941 3899 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.762e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.762e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ITM2A-201ENST00000373298 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.769e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BBS9-207ENST00000433714 3705 ntTSL 1 (best)10.3□□□□□ -0.762e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TOR1AIP1-210ENST00000531630 579 ntTSL 510.29□□□□□ -0.762e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-219ENST00000640048 1670 ntTSL 510.26□□□□□ -0.772e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-218ENST00000639784 1355 ntTSL 510.26□□□□□ -0.772e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FAM118B-201ENST00000360194 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.772e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 POLR1A-205ENST00000462078 469 ntTSL 510.17□□□□□ -0.782e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.782e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.782e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CLASRP-209ENST00000588016 967 ntTSL 210.13□□□□□ -0.792e-34■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AC106886.3-201ENST00000621583 547 ntBASIC10.11□□□□□ -0.792e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DDX55-208ENST00000541259 460 ntTSL 310.09□□□□□ -0.792e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.84e-8■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BBS9-203ENST00000355070 4004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.82e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF780B-201ENST00000221355 3538 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.82e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM131-205ENST00000465767 569 ntTSL 310.01□□□□□ -0.815e-11■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CDK8-206ENST00000625988 795 ntTSL 510□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC35B1-218ENST00000514907 633 ntTSL 59.95□□□□□ -0.822e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 INTS13-206ENST00000538727 552 ntTSL 49.95□□□□□ -0.829e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CTNNAL1-205ENST00000488130 618 ntTSL 39.91□□□□□ -0.822e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SAP30BP-208ENST00000578909 678 ntTSL 59.87□□□□□ -0.832e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF678-205ENST00000608949 929 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.842e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC27-202ENST00000380809 1378 ntTSL 29.77□□□□□ -0.846e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 UVRAG-202ENST00000525183 1325 ntTSL 29.77□□□□□ -0.859e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TDP1-202ENST00000393452 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.852e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CAST-220ENST00000508117 571 ntTSL 59.67□□□□□ -0.866e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NUP50-AS1-203ENST00000609284 710 ntTSL 1 (best)9.66□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.872e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPP1R32-206ENST00000542951 594 ntTSL 29.63□□□□□ -0.872e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GABARAPL1-214ENST00000545047 559 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.872e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MDH2-208ENST00000492663 546 ntTSL 29.57□□□□□ -0.889e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.889e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TDP1-210ENST00000554976 3040 ntTSL 29.56□□□□□ -0.882e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPM1H-204ENST00000551214 862 ntTSL 39.55□□□□□ -0.882e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 29.53□□□□□ -0.882e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.882e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-207ENST00000514776 6541 ntTSL 29.51□□□□□ -0.892e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC10-205ENST00000469118 545 ntTSL 59.43□□□□□ -0.92e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-220ENST00000586831 718 ntTSL 59.4□□□□□ -0.95e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TDP1-203ENST00000393454 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.912e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MR1-206ENST00000438435 883 ntTSL 39.38□□□□□ -0.912e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LRRFIP1-208ENST00000468950 815 ntTSL 59.37□□□□□ -0.912e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 POT1-212ENST00000608057 2036 ntTSL 1 (best)9.34□□□□□ -0.919e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TDP1-208ENST00000553989 728 ntTSL 29.32□□□□□ -0.922e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DEPDC1B-202ENST00000453022 1569 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ITM2A-205ENST00000469541 879 ntTSL 29.27□□□□□ -0.939e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AAED1-203ENST00000446045 2723 ntTSL 1 (best)9.26□□□□□ -0.932e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TDP1-204ENST00000545686 2488 ntTSL 1 (best)9.26□□□□□ -0.932e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CAST-240ENST00000514055 559 ntTSL 59.26□□□□□ -0.936e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AC139256.1-201ENST00000569858 2598 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.942e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-217ENST00000639698 1507 ntTSL 59.15□□□□□ -0.952e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CAST-212ENST00000504221 578 ntTSL 39.11□□□□□ -0.956e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RPS4X-202ENST00000373626 594 ntTSL 39.1□□□□□ -0.952e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL4-219ENST00000534457 987 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.958e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC35B1-215ENST00000511657 548 ntTSL 39.08□□□□□ -0.962e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LEF1-211ENST00000505379 1084 ntTSL 29.04□□□□□ -0.962e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC9A1-202ENST00000374084 695 ntTSL 59.03□□□□□ -0.962e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 JPT1-212ENST00000584079 382 ntTSL 59.01□□□□□ -0.972e-9■■■■■ 223.6
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