Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms