Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms