Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1EQ9GZS1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms