Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIPCQ9C0C6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIPCQ9C0C6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms