Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms