Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms