Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIFKQ9BYG3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms