Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC11CQ9BY50 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.4 ms