Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF17Q9BXT8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms