Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms