Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms