Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SIGMAR1Q99720 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SIGMAR1Q99720 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SIGMAR1Q99720 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SIGMAR1Q99720 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SIGMAR1Q99720 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SIGMAR1Q99720 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SIGMAR1Q99720 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SIGMAR1Q99720 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SIGMAR1Q99720 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SIGMAR1Q99720 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SIGMAR1Q99720 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SIGMAR1Q99720 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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