Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX2Q99697 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX2Q99697 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms