Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms