Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C9orf85Q96MD7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C9orf85Q96MD7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C9orf85Q96MD7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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