Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC11Q96J66 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC11Q96J66 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms