Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAX2Q96IS3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms