Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPNQ96H22 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPNQ96H22 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPNQ96H22 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPNQ96H22 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPNQ96H22 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPNQ96H22 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPNQ96H22 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPNQ96H22 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPNQ96H22 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPNQ96H22 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPNQ96H22 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms