Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NEIL1Q96FI4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms