Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms