Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO17Q96EF6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms