Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM44Q96DX7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms